Jupyter notebook support
With Jupyter Notebook integration available in PyCharm , you can easily edit, execute, and debug notebook source code and examine execution outputs including stream data, images, and other media.
Notebook support in PyCharm includes:
- Coding assistance:
- Error and syntax highlighting.
- Code completion.
- Ability to create line comments Control+/ .
Quick start with the Jupyter notebook in PyCharm
To start working with Jupyter notebooks in PyCharm:
- Create a new Python project, specify a virtual environment, and install the jupyter package.
- Open or create an .ipynb file.
- Add and edit source cells.
- Execute any of the code cells to launch the Jupyter server.
Get familiar with the user interface
Mind the following user interface features when working with Jupyter notebooks in PyCharm.
Notebook editor
A Jupyter notebook opened in the editor has its specific UI elements:
- Jupyter notebook toolbar : provides quick access to the most popular actions. The rest of the notebook-specific actions are available in the Cell menu.
- Code cell : a notebook cell that contains an executable code
- Cell output : results of the code cell execution; can be presented by a text output, table, or plot.
- Cell toolbar : a toolbar of the code cell with the most popular commands. By default, cell toolbars are disabled. To enable them, open project Settings ( Control+Alt+S ), go to Languages & Frameworks | Jupyter , and select the Show cell toolbar checkbox.
Cell toolbar
Each code cell has its configurable toolbar so that you can easily access the most popular commands and actions. By default, cell toolbars are disabled. To enable them, open project Settings ( Control+Alt+S ), go to Languages & Frameworks | Jupyter , and select the Show cell toolbar checkbox.
Executes the code cell. You can also press Control Enter to run the code cell.
Executes this cell and select the cell below. Press Shift+Enter to call the same action.
Moves the current cell up.
Moves the current cell down.
Deletes the current cell.
Open the list of additional call actions:
- Run all above : Executes all cells that preceded the selected cell.
- Debug cell : Runs the Debugger for the current cell. You should set the breakpoint first. Click the gutter next the line to want to stop at.
- Merge Cell Above : Merges the current cell with the cell above.
- Merge Cell Below : Merges the current cell with the cell below.
- Split Cell : Splits the current cell by the selected code line.
- Convert Cell to Code : Converts the current cell into a code cell.
- Convert Cell to Markdown : Converts the current cell into a Markdown cell.
Notebook toolbar
The Jupyter notebook toolbar provides quick access to all basic operations with notebooks:
Adds a code cell below the selected cell.
Moves the selected item or items from the current location to the clipboard. Moves the entire cell if it’s selected.
Copies the selected item or items to the clipboard. Copies the entire cell if it’s selected.
Inserts the contents of the clipboard into the selected location. If you’ve selected an entire cell, the contents are pasted to a new cell below the selected one.
Moves the current cell up.
Moves the current cell down.
Executes this cell and selects a cell below. If there is no a cell below, PyCharm will create it.
Starts debugging for this cell.
Click this icon if you want to interrupt any cell execution.
Executes all cells in the notebook.
You can select a cell type from this list and change the type for the selected cell.
Deletes the current cell.
The Jupyter Server widget that shows the currently used Jupyter server. Click the widget and select Configure Jupyter Server to setup another local or remote Jupyter server.
List of the available Jupyter kernels.
Select this checkbox to allow executing JavaScript in your Jupyter notebook.
This actions selects the cell above.
This actions selects the cell blow.
You can preview the notebook in a browser.
Tool windows
The Server Log tab of the Jupyter tool window appears when you have any of the Jupyter server launched. The Server log tab of this window shows the current state of the Jupyter server and the link to the notebook in a browser.
It also provides controls to stop the running server () and launch the stopped server ().
The Jupyter Variables tool window the detailed report about variable values of the executed cell.
Jupyter notebooks in PyCharm
Today we’re going on a Python adventure using Jupyter notebooks and PyCharm! First, let’s talk about what these are. Jupyter Notebook is a web application where you can create interactive coding documents, supporting many programming languages including both Python and R as well as Markdown. PyCharm is an amazing IDE (interactive development environment) for Python that has tools and plugins to help you code more efficiently. You can develop your code both locally and remotely using PyCharm. First, let’s get set up!
Getting started with PyCharm
- Install PyCharm.I highly recommend installing PyCharm Professional because you get more features like SciView that are awesome for data science. Plus PyCharm Professional is free for students!
- Install Python if you don’t already have it — you’ll need an interpreter in order to use PyCharm! Be aware that Python 2 and Python 3 are different in terms of syntax — don’t worry, you can load either version in PyCharm when you start a new project. If this is your first time developing in Python, I recommend going with the latest version 3.8.3.
- Create a new project in PyCharm and select your local Python interpreter. Here, I created a new project called ‘pycharm’ in a directory on my desktop and selected Python 3.7 as my interpreter.
- Install Jupyter by selecting PyCharm >> Preferences >> Project Interpreter, then click the “+” button to add new packages.
Then type ‘jupyter’ and select jupyter from the packages list. Then click the ‘Install Package’ button at the bottom of the window.
- Create a new Jupyter notebook by navigating to File >> New… and selecting ‘Jupyter Notebook’. Alternatively, if you just want to create a Python script you can select ‘Python File’. Here, I created a new notebook called pycharm.ipynb.
- Let’s start editing our notebook by adding a Markdown cell. In the editor next to the ‘#%’, add ‘md’ to set the cell type to Markdown. Then use Markdown formatting, such as ‘### Header’ like in my example here. Notice that the right side panel displays a preview of your notebook.
- Now let’s add a coding cell. Click the ‘+’ button just below the Markdown cell to add a new cell. Add your code and click the green arrow to run the code in the cell.
Here I created and printed a variable called my_string.
- Let’s check out a cool feature of PyCharm Scientific View. Add the following to a code cell and run it:
import pandas as pd #read in data from my github repo data = pd.read_csv("https://raw.githubusercontent.com/CaitlinCasar/Casar2020_DeMMO_MineralHostedBiofilms/master/orig_data/site_geochem.csv") data.head()- Next, open your Jupyter tab at the bottom of your PyCharm window, click on the variables tab, and right click on the new variable you just created called ‘data’. Select ‘View as Dataframe’, then click on the ‘SciView’ tab on the right panel.
This is a great feature for viewing your stored variables. You can view both dataframes and arrays with SciView.
- Let’s try launching this notebook in our browser. Click on the text at the bottom of your PyCharm window that says “Jupyter Server started at http://localhost:8888// Open in Browser”. You should see an Event Log window pop up in the bottom right panel. Click on “Open in Browser” to launch your notebook in your web browser.
You should now see something like this in your browser:
Click on the notebook to run your code in the browser window. You can run cells by clicking the Run button in the top tool bar, or by clicking Ctrl + Enter.
Sync files with a remote server
- Let’s say you want to sync files on a remote server. You’ll need to set up your file transfer protocol. Select Tools >> Deployment >> Browse Remote Host. Then select your protocol — here I chose SFTP (secure file transfer protocol).
- Next, configure your connection to the remote host by adding your IP address and log in credentials. Optionally, set your root path to the path on the remote server where you want to access files.
- Click on the Mapping tab and set your local path to your project directory in PyCharm. Set the deployment path to the directory on the remote server where you want to access or upload files.
- Sync your local directory with the remote directory by right-clicking on your project in the left panel, then select Deployment >> Sync with Deployed To…
Then click the green double arrow button “Synchronize All” to sync your files. You can use the ‘Remote Host’ tab on the right panel to view your remote file tree.
Run a remote Jupyter server kernel
If you want to run an interactive Jupyter notebook on a remote server in PyCharm, you’ll need to set up your Jupyter server configuration and remote Python interpreter.
- In the terminal, SSH into your remote server, navigate to the directory where your data is, then launch a Jupyter notebook.
- Navigate to the directory where your data is located. Then launch a jupyter notebook by running the following:
#replace port number with whatever port you want jupyter notebook --port=8899 --no-browserThis will return a url and token, similar to:
https://my-notebook/tree/?token=abcdef.Copy this entire url and token. Make sure you copy it all from one line — I have to make my terminal full screen for this. Otherwise you might get a weird line break and your url/token might not work.
- Open a new Jupyter notebook file and select ‘Configure jupyter server…’.
Paste your url and token in the field for ‘Configured Server’. Then click ‘Apply’.
- You should now be able to access data on the remote server in your Jupyter notebook. Here, I cloned my repo on the remote server, and I’m accessing a csv file with the pandas library.
- If you want to use an interpreter on the remote server, you can figure the interpreter by naviating to Pycharm >> Preferences >> Project Interpreter…, then select the wheel button next to your current interpreter and select ‘Add…’. Then select ‘SSH interpreter’ and choose ‘Existing server configuration’. From the dropdown menu, select the SSH configuration that you set up in step 2 of the ‘Sync files with a remote server’ above.
Note:Unfortunately, you cannot view your variables while using a remote Jupyter server kernel as documented here.
Congrats on developing in Jupyter Notebooks and PyCharm! I hope you enjoyed this tutorial, feel free to comment below with any comments/questions! ��
Как установить jupiter в pycharm
Скачай курс
в приложенииПерейти в приложение
Открыть мобильную версию сайта© 2013 — 2023. Stepik
Наши условия использования и конфиденциальности
Public user contributions licensed under cc-wiki license with attribution required
Программирование на Python
Это страница обязательного курса «Программирование на Python», читаемого на программе «Бизнес-информатика» 2 курса бакалавриата в 4 модуле 2022-2023 учебного года.
Занятия ведёт: Тамбовцева Алла Андреевна.
- 1 Правила игры
- 2 Программное обеспечение
- 3 Материалы занятий
- 3.1 Введение в Python. Переменные и типы данных. Ввод и вывод. (8 апреля)
- 3.2 Списки и кортежи. Цикл for. Строки и методы на строках. (15 апреля)
- 3.3 Условные конструкции и цикл while. Работа с текстовыми файлами. (22 апреля)
- 3.4 Множества и словари (29 апреля)
- 3.5 Введение в парсинг с BeautifulSoup (13 мая)
- 3.6 Функции в Python. Lambda-функции (20 мая)
- 3.7 Массивы NumPy и датафреймы Pandas (27 мая)
- 3.8 Более продвинутые примеры парсинга и работа с API на примере ВКонтакте (3 июня)
- 3.9 Более продвинутые примеры парсинга и библиотека Selenium (10 июня)
- 3.10 Классы в Python. Веб-приложения со streamlit. (17 июня)
Правила игры
Формула оценки: Итог = 0.3 * Контрольная работа + 0.3 * Домашние задания + 0.4 * Экзамен.
- Контрольная работа состоит из двух частей: теоретической и практической. Теоретическая часть содержит тестовые и открытые вопросы по синтаксису, типам и структурам данных в Python, во время её выполнения нельзя запускать код на компьютере и пользоваться материалами. Практическая часть состоит из задач по программированию, во время её выполнения можно пользоваться любыми открытыми источниками, но нельзя создавать новые вопросы на форумах и подобных ресурсах. Оценка за КР – целое число в 10-балльной шкале.
- Экзамен проходит в том же формате, что и контрольная работа. Оценка за экзамен – целое число в 10-балльной шкале.
- Домашние задания представляют собой набор задач по программированию по пройденным темам. Оценка за домашние задания – неокруглённое среднее арифметическое за все домашние задания по курсу.
При сдаче домашнего задания позже указанного срока предусмотрены штрафы. Опоздание в пределах часа ведёт к штрафу 10% от полученной оценки, в пределах суток – к штрафу 30%, в пределах недели – к штрафу 70%.
Программное обеспечение
На курсе мы будем работать в двух средах: Jupyter Notebook и PyCharm. Jupyter Notebook мы будем активно использовать в начале курса, плюс, эта среда будет нужна для сдачи домашних заданий через систему с автоматическими тестами для проверки.
Jupyter Notebook – продукт проекта Jupyter, более простая среда для знакомства с языком, часто используется в дата-аналитике и машинном обучении, позволяет создавать красиво оформленные файлы с кодом, текстом и графиками (файлы с расширением .ipynb).
Jupyter Notebook можно скачать как отдельно, так и внутри дистрибутива Anaconda, который включает в себя интерпретатор языка Python, библиотеки для обработки, анализа и визуализации данных:
- Если у вас установлен интерпретатор Python и вы знакомы с командой pip install, можно поставить Jupyter Notebook отдельно по этой инструкции.
- Если вы не знакомы с Python, рекомендуется поставить дистрибутив Anaconda, скачать можно здесь.
Также есть возможность работать в Jupyter Notebook онлайн, используя ресурс Google Colab (для создания и редактирования файлов нужен аккаунт Gmail).
PyCharm – профессиональная среда для разработки, работает преимущественно с исполняемыми файлами, содержащими программы на Python (файлы с расширением .py). PyCharm в бесплатной версии Community умеет открывать ipynb-файлы, созданные в Jupyter Notebook, но только режиме чтения, редактировать их нельзя. Скачать можно здесь, достаточно версии Community.
Материалы занятий
Введение в Python. Переменные и типы данных. Ввод и вывод. (8 апреля)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Знакомство со средой Jupyter Notebook: инструкция по работе, Jupyter Notebook и Markdown (читать, ipynb).
- Вычисления и переменные в Python (читать, ipynb). Типы данных, ввод и вывод, форматирование строк (читать, ipynb).
- Практикум 1 (читать, ipynb), решения (читать, ipynb).
- Стандарты оформления кода Python: PEP8.
- Pythontutor: визуализатор кода, вычисления, ввод и вывод.
- Markdown и Jupyter: больше про Markdown, интерактивные виджеты в Jupyter.
- LaTeX: ShareLaTeX для желающих, документация на английском, материалы других курсов по LaTeX.
Списки и кортежи. Цикл for. Строки и методы на строках. (15 апреля)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Списки и цикл for, функция range() (читать, ipynb). Методы на списках (читать, ipynb). Функция zip() и кортежи (читать, ipynb).
- Строки и методы на строках (читать, ipynb).
- Практикум 2 (читать, ipynb), решения (читать, ipynb).
- Pythontutor: списки, цикл for, строки.
Условные конструкции и цикл while. Работа с текстовыми файлами. (22 апреля)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Альтернативы циклу for (читать, ipynb). Условные конструкции (читать). Цикл while (читать, скачать).
- Чтение и запись текстовых файлов (читать, ipynb), файл intro.txt.
- Практикум 3 (читать, ipynb), решения (читать, ipynb).
- Практикум 4 (читать, ipynb), решения (читать, ipynb), файл ducks.txt.
- Pythontutor: условия, цикл while.
Множества и словари (29 апреля)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Множества (читать). Словари и методы на словарях (читать, ipynb).
- Практикум 5 (читать, ipynb), решения (читать, ipynb).
Введение в парсинг с BeautifulSoup (13 мая)
- Практикум 6 (читать, скачать), решения практикума (читать, скачать).
Функции в Python. Lambda-функции (20 мая)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Функции (читать, ipynb). Более подробная лекция по функциям (автор И.В.Щуров).
- Lambda-функции (читать, ipynb).
- Исключения и конструкция try-except (читать, скачать).
- Практикум 7 (читать, скачать), решения (читать, скачать).
Массивы NumPy и датафреймы Pandas (27 мая)
- Видеозаписи занятий и ipynb-файлы.
- Массивы и датафреймы pandas: введение (читать, ipynb).
- Операции с датафреймами pandas (читать, ipynb), файл Salaries.csv.
- Pandas, scipy и проверка гипотез читать, ipynb, файл NPK.xlsx.
Более продвинутые примеры парсинга и работа с API на примере ВКонтакте (3 июня)
- Видеозаписи и ipynb-файлы.
- Примеры парсинга данных в псевдотабличном виде (читать, ipynb).
- Примеры парсинга с BeautifulSoup и Pandas (читать, ipynb).
- Инструкция по получению доступа к API ВКонтакте.
- Практикум по выгрузке постов со стены сообщества (читать, ipynb).
Более продвинутые примеры парсинга и библиотека Selenium (10 июня)
- Видеозаписи и ipynb-файлы.
- Краткое введение в регулярные выражения (читать, ipynb).
- Парсинг HTML, обработка JSON и регулярные выражения (читать,ipynb).
- Инструкция по установке драйверов для Chrome, ссылка на драйвера.
- Практикум по парсингу с библиотекой Selenium (читать, ipynb).
- Неофициальная документация библиотеки Selenium.
- Управление браузером с Selenium на примере ВКонтакте (читать, скачать).
- Управление браузером с Selenium: XPATH и скачивание файлов (читать, скачать).
- Управление браузером с Selenium: пример динамической страницы (читать, скачать).
Классы в Python. Веб-приложения со streamlit. (17 июня)
- Видеозаписи и ipynb-файлы.
- Классы в Python (читать, ipynb).
- Веб-приложения со streamlit.